和绝大多数病毒一样，HBV具有相对简单的结构，由DNA和包绕它的蛋白质组成(见图)

　　HBV的结构。病毒的组成包括：内部的核心部分——含DNA和DNA聚合酶(病毒复制所需的酶)，包围核心的外壳(或衣壳)以及外部的包膜。衣壳和包膜都由蛋白质组成。

　　绝大部分HBV的蛋白质都能刺激免疫系统，因而都被称为抗原：

　　核心蛋白——乙型肝炎核心抗原，简称HBcAg；

　　包膜蛋白或表面蛋白——乙型肝炎表面抗原，简称HBsAg；

　　核心蛋白的另外一种蛋白组分——乙型肝炎e抗原，简称HBeAg。

　　HBV可以感染多种细胞，但它更倾向于感染肝细胞，其中原因尚未明了。HBV与肝细胞表面的一些小蛋白(受体)结合，进入细胞。一旦成功进入肝细胞，HBV可利用细胞的复制系统复制自身的DNA，并产生自身的蛋白质。尽管肝细胞已被感染，但病毒并不引起细胞明显的损伤，细胞在有病毒存在的情况下持续存活。由于HBV并不杀伤被其感染的细胞，因而HBV是一种不具有细胞毒性的病毒。HBV感染后产生的肝损伤(或肝炎)并非由病毒引起，而是机体自身的抗感染免疫应答所致。受感染肝细胞的破坏导致血中丙氨酸氨基转移酶(ALT)水平的显著升高(ALT是一种由肝细胞产生的酶，当肝细胞受到损伤时，该酶被释放入血)。

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