皮下脂肪瘤无明显特殊病因。患者体细胞内存在一种致瘤因子，在正常情况下，这种致瘤因子处于一种失活状态（无活性状态），皮下脂肪瘤正常情况下不会发病，但在各种内外环境的诱因影响作用下，这种脂肪瘤致瘤因子处于活跃状态，在机体抵抗力下降时，机体内的淋巴细胞、单核吞噬细胞等免疫细胞对致瘤因子的监控能力下降，再加上体内的内环境改变，慢性炎症的刺激、全身脂肪代谢异常等诱因，脂肪瘤致瘤因子活性进一步增强，并与机体正常细胞中某些基因片段结合，形成基因异常突变，使正常的脂肪细胞与周围的组织细胞发生一种异常增生现象，导致脂肪组织沉积，并向体表或各个内脏器官突出形成肿块，称之脂肪瘤。