以SMZ-TMP预防PCP临床已获得成功。Harris等对229例PCP高危小儿肿瘤患者，以SMZ-TMP 20～4 mg/(kg·d)口服，其中ALL于预防CNST时(第28天)开始给药，维持至少1年;对ANLL或实体肿瘤患者于化疗开始同时投药，结果无一例发生PCP。而另外10例高危患者未予预防性投药，有5例发生PCP，说明此量预防效果是可靠的。301总医院儿科正是在白血病患儿发生PCP后提高了对本病的认识，于1988年制定了在白血病CR常规给予SMZco 20mg/(kg·d)，分2次口服，每周连服3天停4天的预防方案。此后收治的易患PCP的高危患儿仅一例发病，此一例恰为未坚持服用SMZco的患儿，说明采用3天连续疗法可达同样预防效果，不仅不会增加其他病原体的感染率和副作用，而且还可以大大降低病人全身性真菌感染的发生率。对于PCP完全恢复的患者仍须采取预防措施，否则可发生再次感染。在成人，不能耐受TMP SMZ的病人，替代药物有喷他脒、克林霉素/乙胺嘧啶;氨苯砜单独或与TMP、乙胺嘧啶合用，广泛用于AIDS或接受移植的病人;乙胺嘧啶与磺胺多辛成功地用于卡氏肺囊虫的预防。